中心主任：陳秋妏　教授 (分機23761)

　•負責中心各項工作計畫之研擬及監督。

副主任：陳志峰　博士 (分機23762)

　•協助主任綜理中心事務。

研究發展組：

　•監測技術改良
　•整治技術研發
　•分析技術研發

專案計畫組：

　•行政會計工作：專案計畫之資料管理，辦理產學合作計畫相關行政、會計及總務作業。
　•工作計畫研擬：研擬專案計畫執行工作計畫書，安排及規劃計畫相關執行期程、項目及工作內容。
　•專案技術報告：撰寫專案計畫成果報告。

檢測分析組：

　•樣本採集/分析：專案計畫之現場採集與實驗室分析工作。
　•儀器校正測試：中心分析儀器校正測試與維護管理工作。
　•數據品保品管：專案計畫分析方法建立與數據品保品管控制。