本中心提供水域環境底泥監測、整治、管理及處理技術開發等相關的完整服務，包含下列項目：

 (一) 水域環境現場採樣監測服務
 (二) 水域環境各介質基本性質分析服務
 (三) 水域環境底泥、水體及生物體重金屬及有機污染分析與評估服務
 (四) 水域環境底泥、水體及生物體毒性化學物質分析與評估服務
 (五) 底泥污染現址(in-situ)處置方案與防治策略評估服務
 (六) 底泥復育淨化，底泥產品資源化等離址(ex-situ)技術研發服務
 (七) 人員教育訓練及技術轉移服務
 (八) 設置模廠之規劃、顧問與技術移轉服務